O programa dispõe de algumas boas opções de formato de codificação, como AVI, MPEG e FLV. No caso de vídeos em Flash, o TubeBox! ainda funciona como conversor, seja codificando-os para outros formatos de vídeo ou apenas para áudio.
A qualidade de imagem e áudio varia de acordo com a qualidade original, mas uma coisa é certa, se a qualidade original for boa, a versão baixada não deixará nem um pouco a desejar. Portanto fica a dica: é interessante que o usuário dê uma olhada no vídeo antes, seja no preview oferecido pelo programa ou diretamente no site onde ele estiver hospedado.